这里要讲的杀毒方法是：在纯DOS模式下杀毒和使用专杀工具在安全模式下杀毒。
　　 为什么要到纯DOS模式下杀毒呢？
　　 因为病毒程序是在操作系统解释模式下运行的，如：脚本病毒“新欢乐时光”、批处理命病毒“玛姆”等，它们运行时在内存中是不可见的，而系统也会因为它们都是合法的程序而对其加以保护，保证它能继续运行，禁止对正在运行程序进行修改，这就造成了病毒不能被清除的原因。而只有在纯DOS模式下，连Windows操作系统都没能被运行，病毒就更不可能运行，因此这时对其查杀，就绕过了系统的保护，达到干净杀毒的效果。
　　 纯DOS模式查毒的方法。
　　 准备三张空白3.5英寸软盘，使用金山毒霸自带的“创建应急盘”工具，创建DOS引导盘和杀毒盘。然后使用引导盘引导系统，引导后，等待提示，再插入杀毒盘，金山毒霸会自动完成在DOS下的杀毒工作。
　　创建应急盘的步骤如下：
　　1． 通过“开始|程序|金山毒霸V|制作应急盘”，或者通过金山毒霸主界面的“我的金山毒霸|所有菜单|制作应急盘”，则弹出对话框：
　　　　在弹出的对话框中选择“确定”，继续执行创建操作。
　　［注意］ 如果您已经备有一张 Windows 的启动盘，则不用选择“创建应急启动盘”，此处以创建应急DOS杀毒盘为例，两者创建方法相同。
　　2． 请关闭软盘写保护，插入软盘驱动器。按“开始创建”按钮，进行创建。如果软盘不为空，在此时会先提示您格式化软盘。然后再进行创建。
　　3． 程序开始创建应急（DOS）杀毒盘，拷贝金山毒霸命令行版本文件，以及病毒库文件，并显示状态条。
　　4． 当全部文件拷贝完毕，程序显示“创建应急（DOS）杀毒盘结束！”的信息，并提示您在该盘上贴上标签，操作完毕后，请“确定”：当所有操作结束后，金山毒霸会向您提示“创建金山毒霸应急盘成功”的信息。
　　 使用非应急盘方式
　　 从Windows系统中切换到纯DOS模式，有两种方法：一是点击开始菜单，选择“关闭系统”，再选中“关闭计算机并切换到MS-DOS方式”，点确定进入纯DOS模式。二是在系统引导时，按F8键，呼出启动菜单，按数字键选择“Comand prompt only”进入纯DOS模式。进入纯DOS模式以后，切换到金山毒霸的安装目录，敲入Kavdx，运行DOS版的金山毒霸来开始杀毒。此方法仅限于Win95/Win98系统。